据报道，德国各地目前报告的确诊或疑似病例总数已超过1500例，已知因病死亡人数已达15人。西班牙黄瓜可能是本次疫情的“罪魁祸首”被证实系误报之后，德国医学专家开始猜测其他可能的感染源。明斯特大学医院卫生研究所所长卡希31日说，人和其他一些动物都有可能是这类病菌的传染源。明斯特大学医学系主任施米茨则说，还需要确定已治愈出院的肠出血性大肠杆菌感染者是否还会排泄出病菌，从而对周围人构成威胁。德国明斯特大学的研究说，导致德国这次疫情的特殊病菌过去10年间毒性增加了两至三倍。
肠出血性大肠杆菌O104是一种罕见血清型细菌，此前未见致暴发报道。患者以急性腹泻、腹痛起病，之后出现溶血性尿毒综合征，继而可发生多器官受损，甚至死亡。欧洲疾病预防与控制中心（ECDPC）表示，菌株经常会在牲畜体内发现，除了牲畜之间的接触外，它还会通过受污染的食物和水进行传播。
卫生部要求，各级医疗机构要加强病例的监测，发现急性血样便腹泻、腹痛病例，或有急性肾功能衰竭、溶血性贫血、血小板减少等溶血性尿毒综合征临床表现的病例，应询问近期有无赴德国或其周边国家的旅行史。
卫生部要求，各级医疗卫生机构要切实做好患者及密切接触者的健康教育，要求其注意个人卫生尤其是手部卫生；要做好患者排泄物的消毒处理和环境卫生消毒工作，防止发生院内感染。卫生部同时提醒，2011年4月以来有德国及其周边国家旅行史者，如出现急性血样便腹泻、腹泻后无尿或少尿等表现，应及时就诊，并主动告知旅行史。
中国疾控中心发布健康提示指出近期赴德国旅行人员，要保持良好卫生习惯，暂时避免生食西红柿、黄瓜及生菜等。如生吃瓜果蔬菜，务必彻底洗净；凉菜、肉制品要做到生熟分开处理和存放；不要喝生水；饭前便后要洗手，接触动物及其粪便后要彻底洗手。